La Team Ultima fut fondé par une femme, il y a de cela plusieurs années. Au début petite, l'organisation se faisait discrète, volant ici et là des objets de valeurs, ou des Pokémons à vendre aux marchés noirs. Néanmoins, avec le temps, l'entreprise criminel s'agrandit considérablement, profitant de la mise en déroute des autres entreprises criminels pour s'agrandir. Depuis, la Team Ultima possède des branches de l'organisation sur toutes les différentes régions, allant de Kanto jusqu'à Unys.

Peut de gens connaissent les véritables intentions de cette organisations. Ils ne rêvent non pas de la fin du monde, mais bien de créer un endroit pour eux, une utopie, une région où seul les plus forts et les plus méritant, cet à dire eux, pourront vivre.

Ils ne sont pas aussi dangereux et extrémiste que certaines organisations criminels, néanmoins, pour eux, personnes ne méritent de se mettre en travers de leurs routes. Ils ne prennent dans leurs équipes que ceux qu'ils considèrent comme assez fort, ou assez intelligent.

Ils se spécialisent dans le dressages de Pokémons de type , et TypeTénèbre . Leur chef, Ishtar Sakipat Naviento elle est spécialiser dans les Pokémon . Ils volent des Pokémons. Ceux qu'ils considèrent assez fort, ou ayant assez de potentiel sont conserver, puis dresser dans le but de devenir encore meilleur. Ceux qu'ils jugent trop faible sont revendu.

La base secrète de la Team Ultima se situe dans le Mont Braise, cacher au plus profond de cet ancien volcan des îles Sevii. Seuls les membres de la Team Ultima connaissent l'emplacement exacte de cette base secrète, parfaitement à l'abris du reste du monde.